山东艺术类音乐考生只能填报获得专业资格证书的高校吗

这个要分两种情况吧。
如果你有参加省统考，那么所有用省统考成绩录取的学校都能填。
如果没有省统考，那么只能填报有合格证的学校。

山东艺术学院音乐学院的介绍

山东艺术学院主干院（系）之一，音乐学为省级重点学科，国家硕士学位授予点。学院现有五大教研室，分别是声乐教研室、管弦教研室、民乐教研室、键盘教研室和理论教研室。设有音乐表演、音乐学、作曲与作曲技术理论三个本科及研究生专业的八个方向：⒈演唱、⒉管弦（打击）乐器演奏、⒊中国乐器演奏、⒋键盘乐器演奏、⒌音乐学、6钢琴调律、⒎作曲与作曲技术理论、⒏电子音乐作曲与制作。